W latach 30. XX wieku (era "Showa") kwitł handel bonami skarbowymi.
W marcu 1943 roku "Japan Securities Exchange Law" postanowił reorganizować giełdę na czas wojny. 30 czerwca 1943 roku 11 japońskich giełd (łącznie z giełdą tokijsją) zostało zjednoczone jako instytucje "quasi" - monopol własności publicznej, pod szyldem "Japan Securities Exchange", jednak taka kombinacja nie ostała się zbyt długi i zlikwidowano ją w kwietniu 1947 roku.
W związku, z częstymi nalotami wrogich samolotów na główną wyspę Japonii, zawieszono handel papierami wartościowymi na giełdzie do 10 sierpnia 1945 roku, ponownie otwarto ją we wrześniu 1945 roku.
1 kwietnia 1949 roku powstały 3 giełdy w Tokio, Osace and Nagoi - handel rozpoczęto 16 maja.
W lipcu, tego samego roku, powołano 5 kolejnych giełd w Kyoto (w marcu 2001 roku połączono z Osaka Securities Exchange), Kobe (zlikwidowano w październiku 1967), Hiroshima (połączono z Tokyo Stock Exchange w marcu 2000), Fukuoka oraz Niigata (połączono z Tokyo Stock Exchange w marcu 2000). W kwietniu 1950 roku powołano Sapporo Securities Exchange.